Công ty cổ phần Lương thực A An bị giảm khấu trừ thuế gần 445 triệu đồng sau kiểm tra

Bên cạnh khoản tiền phải nộp bổ sung vào ngân sách, quyết định xử lý thuế đối với Công ty cổ phần Lương thực A An (từ đây goi tắt là Lương thực A An) còn làm thay đổi số thuế giá trị gia tăng (GTGT) được khấu trừ của doanh nghiệp. Đây là hai nội dung tài chính cần được phân biệt khi đánh giá kết quả kiểm tra thuế đối với một doanh nghiệp đang niêm yết trên thị trường chứng khoán.

Hơn 531 triệu đồng tiền phạt, truy thu và chậm nộp

Theo thông tin Công ty cổ phần Lương thực A An công bố ngày 5/11/2026, doanh nghiệp đã nhận quyết định xử phạt vi phạm hành chính về thuế của Cục Thuế TP. Hà Nội.

Các sản phẩm gạo mang thương hiệu A An của Công ty cổ phần Lương thực A An - doanh nghiệp đang niêm yết trên HOSE với mã chứng khoán AAN - Ảnh: https://aan.vn

Các vi phạm được xác định liên quan đến việc kê khai sai dẫn đến thiếu số thuế phải nộp và kê khai sai, không đầy đủ một số chỉ tiêu trên hồ sơ thuế GTGT trong giai đoạn từ tháng 1/2024 đến tháng 12/2025.

Cụ thể, Lương thực A An bị phạt hành chính gần 173 triệu đồng, gồm hơn 66 triệu đồng đối với hành vi khai sai dẫn đến thiếu thuế và khoảng 107 triệu đồng đối với hành vi kê khai sai, không đầy đủ các chỉ tiêu xác định nghĩa vụ thuế trên tờ khai GTGT nhưng không làm thiếu số thuế phải nộp.

Ngoài tiền phạt, Cơ quan Thuế còn yêu cầu doanh nghiệp nộp bổ sung hơn 331 triệu đồng tiền thuế, trong đó hơn 53 triệu đồng phát sinh năm 2024 và gần 278 triệu đồng của năm 2025.

Doanh nghiệp phải nộp gần 27 triệu đồng tiền chậm nộp thuế thu nhập doanh nghiệp. Như vậy, tổng số tiền phạt, truy thu và chậm nộp theo quyết định xử lý vượt 531 triệu đồng.

Quyết định yêu cầu doanh nghiệp chấp hành trong thời hạn 10 ngày kể từ ngày nhận được quyết định. Trường hợp quá thời hạn mà không tự nguyện thực hiện, việc cưỡng chế thi hành được áp dụng theo quy định của pháp luật hiện hành.

Các hành vi được xác định trong quyết định xử phạt là vi phạm hành chính về kê khai thuế. Quyết định này không phải căn cứ để kết luận Lương thực A An có hành vi trốn thuế hoặc gian lận thuế. Việc xác định các hành vi khác, nếu có, phải dựa trên kết quả kiểm tra, xác minh và quyết định của cơ quan có thẩm quyền.

Gần 445 triệu đồng thuế GTGT được khấu trừ bị điều chỉnh giảm

Bên cạnh nghĩa vụ nộp tiền, Lương thực A An còn phải điều chỉnh giảm gần 445 triệu đồng số thuế GTGT được khấu trừ chuyển sang kỳ sau. Đây là nội dung đáng chú ý bởi khoản điều chỉnh này có bản chất khác với tiền phạt hoặc tiền thuế truy thu.

Theo cơ chế khấu trừ thuế GTGT, số thuế đầu vào đủ điều kiện nhưng chưa được khấu trừ hết có thể được chuyển sang kỳ tính thuế tiếp theo theo quy định. Khi số thuế được khấu trừ bị điều chỉnh giảm, phần giá trị doanh nghiệp có thể sử dụng để khấu trừ trong các kỳ tiếp theo cũng giảm tương ứng.

Vì vậy, gần 445 triệu đồng không phải khoản tiền phạt bổ sung và không được cộng trực tiếp vào hơn 531 triệu đồng phải nộp.

Hai chỉ tiêu phản ánh những tác động khác nhau của quyết định xử lý thuế: một bên là nghĩa vụ thanh toán, bên còn lại là điều chỉnh số thuế được khấu trừ. Việc phân biệt này đặc biệt quan trọng đối với cổ đông và nhà đầu tư khi theo dõi thông tin tài chính của doanh nghiệp niêm yết.

Doanh thu 9 tháng tăng 32%, lợi nhuận tăng 70%

Lương thực A An được thành lập tháng 1/2021, hoạt động trong lĩnh vực kinh doanh lương thực, thực phẩm, với sản phẩm chủ lực là gạo. Qua tìm hiểu được biết, doanh nghiệp đã trải qua nhiều lần điều chỉnh vốn điều lệ. Sau đợt chào bán 30 triệu cổ phiếu cho cổ đông hiện hữu vào tháng 11/2025, vốn điều lệ tăng lên 650 tỷ đồng. Đến ngày 30/9/2026, vốn điều lệ của Lương thực A An đạt 916,5 tỷ đồng.

Về cơ cấu sở hữu, Công ty cổ phần Siba Holdings là cổ đông lớn, nắm giữ 52,14% vốn điều lệ. Phần còn lại thuộc các cổ đông sở hữu dưới 5%.

Trong quý III/2026, Lương thực A An ghi nhận doanh thu 1.223 tỷ đồng, tăng 49% so với cùng kỳ. Lợi nhuận gộp đạt 79 tỷ đồng, tăng 84%. Mặc dù chi phí tài chính, bán hàng và quản lý doanh nghiệp đều tăng, lợi nhuận ròng quý III vẫn đạt khoảng 22 tỷ đồng, gấp đôi cùng kỳ năm trước. Lũy kế 9 tháng đầu năm, doanh nghiệp ghi nhận 3.224 tỷ đồng doanh thu, tăng 32%; lợi nhuận sau thuế đạt gần 43 tỷ đồng, tăng 70%.

Theo giải trình của doanh nghiệp được công bố cùng kết quả kinh doanh, tăng trưởng đến từ việc mở rộng hệ thống phân phối, gia tăng sản lượng tiêu thụ và cải thiện hiệu suất vận hành. Một phần thu nhập trong năm 2026 cũng được áp dụng thuế suất thu nhập doanh nghiệp 15%, thay vì mức 20% như cùng kỳ.

Cổ phiếu AAN bắt đầu giao dịch trên HOSE từ ngày 22/5/2026. Việc công bố quyết định xử phạt thuế vì vậy là thông tin liên quan trực tiếp đến nghĩa vụ minh bạch của doanh nghiệp niêm yết.

Trong bối cảnh kết quả kinh doanh tăng trưởng, việc thực hiện đầy đủ quyết định xử lý thuế và phản ánh chính xác các khoản điều chỉnh trên hồ sơ kế toán, thuế tiếp tục là yêu cầu sát sườn đối với Lương thực A An.