Mặc dù tạm dừng, nhưng Sở Y tế phải thường xuyên và chủ động phối hợp thực hiện các nhiệm vụ về phòng, chống dịch COVID-19 trong tình hình mới; thường xuyên cập nhật, theo dõi, dự báo diễn biến dịch bệnh trong và ngoài TP để tham mưu, chỉ đạo kịp thời. Công an TP chỉ đạo các cơ quan chức năng nắm bắt tình hình có liên quan đến dịch bệnh, quản lý cư trú, xuất nhập cảnh, kịp thời phát hiện các trường hợp đi về từ vùng dịch không khai báo y tế hoặc nhập cảnh trái phép để có biện pháp xử lý.
Nếu dịch bệnh diễn biến phức tạp, Bộ tư lệnh TP kịp thời tham mưu hoạt động trở lại của Sở Chỉ huy. Sở Chỉ huy phòng, chống dịch COVID-19 TP.HCM được thành lập đầu tháng 7-2021, khi tình hình dịch bệnh trên địa bàn TP diễn biến phức tạp. Đến ngày 1-9, UBND TP.HCM có quyết định kiện toàn Sở Chỉ huy phòng chống dịch TP.

Sở Chỉ huy có nhiệm vụ tham mưu quyết định các chủ trương, kế hoạch, biện pháp phòng chống dịch COVID-19. Dự báo tình huống, khả năng có thể xảy ra các cấp độ dịch. Nghiên cứu, đề xuất kinh phí mua sắm trang thiết bị phòng, chống dịch COVID-19 cho các cơ quan, đơn vị theo quy định của pháp luật và các nguồn tài trợ khác.
Sở Chỉ huy có nhiệm vụ quan trọng trong việc quyết định các báo cáo, xin ý kiến chỉ đạo của cấp trên về áp dụng các biện pháp theo quy định của pháp luật, các biện pháp cần thiết trong tình huống dịch bệnh vượt quá khả năng TP như ban bố tình trạng khẩn cấp về dịch bệnh COVID-19, thực hiện lệnh giới nghiêm. Trong tình huống khẩn cấp, báo cáo ngay cấp trên để điều động lực lượng, phương tiện, vật chất để hỗ trợ các lực lượng nhằm sớm ổn định tình hình.
ĐT