Hiệp hội Rau quả Việt Nam kiến nghị gỡ vướng thuế GTGT, hóa đơn điện tử

Cục Thuế (Bộ Tài chính) vừa có văn bản trả lời kiến nghị của Hiệp hội Rau quả Việt Nam liên quan đến chính sách thuế giá trị gia tăng (GTGT) và hóa đơn điện tử trong hoạt động sản xuất, kinh doanh nông nghiệp.

Theo Hiệp hội Rau quả Việt Nam, một số quy định về chứng từ trong hoạt động mua bán giữa doanh nghiệp và hộ sản xuất đang gây khó khăn cho doanh nghiệp. Hiệp hội đồng thời đề nghị cơ quan chức năng xem xét, tháo gỡ những vướng mắc liên quan đến thuế GTGT đầu vào phục vụ sản xuất.

Hiệp hội Rau quả Việt Nam kiến nghị gỡ vướng thuế GTGT, hóa đơn điện tử.

Làm rõ quy định về hóa đơn điện tử đối với hộ kinh doanh

Trả lời kiến nghị, Cục Thuế cho biết chính sách thuế và quản lý thuế đối với hộ, cá nhân kinh doanh đã được quy định tại khoản 2 Điều 1 Nghị định số 141/2026 sửa đổi, bổ sung khoản 5 Điều 8 Nghị định số 68/2026 của Chính phủ.

Theo đó, hộ, cá nhân kinh doanh có doanh thu năm trên 1 tỷ đồng phải áp dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền có kết nối dữ liệu với cơ quan thuế.

Trường hợp hộ, cá nhân kinh doanh có nhiều địa điểm kinh doanh, việc sử dụng hóa đơn thực hiện theo mã số thuế của hộ, cá nhân kinh doanh cho tất cả các cửa hàng và phải ghi rõ mã địa điểm kinh doanh trên hóa đơn.

Đối với hộ, cá nhân kinh doanh có doanh thu năm từ 1 tỷ đồng trở xuống, nếu đáp ứng điều kiện và có nhu cầu sử dụng hóa đơn điện tử thì được đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền có kết nối dữ liệu với cơ quan thuế.

Trường hợp hộ, cá nhân kinh doanh mới ra kinh doanh hoặc có doanh thu năm trước chưa trên 1 tỷ đồng nhưng trong năm tính thuế có doanh thu từ trên 1 tỷ đồng trở lên, phải áp dụng hóa đơn điện tử. Việc đăng ký sử dụng được thực hiện trong thời hạn 30 ngày kể từ ngày cuối cùng của kỳ tính thuế có doanh thu lũy kế trên 1 tỷ đồng.

Cục Thuế cũng dẫn quy định tại Nghị định số 254/2026 của Chính phủ về hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử. Theo đó, hộ, cá nhân kinh doanh có doanh thu năm trên 1 tỷ đồng hoặc hộ, cá nhân kinh doanh bán tài sản phải đăng ký quyền sở hữu, quyền sử dụng thuộc trường hợp phải áp dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế hoặc hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền có kết nối dữ liệu với cơ quan thuế.

Những hộ, cá nhân kinh doanh không thuộc trường hợp bắt buộc sử dụng hóa đơn điện tử nhưng có nhu cầu vẫn có thể đăng ký sử dụng theo quy định.

Đáng chú ý, hộ, cá nhân kinh doanh bán hàng hóa, dịch vụ thuộc trường hợp lập bảng kê thu mua hàng hóa, dịch vụ theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp thì không phải sử dụng hóa đơn điện tử, trừ trường hợp đã đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử.

Từ các quy định trên, Cục Thuế khẳng định pháp luật hiện hành đã quy định cụ thể các trường hợp hộ, cá nhân kinh doanh phải sử dụng hóa đơn điện tử, được đăng ký sử dụng theo nhu cầu hoặc không thuộc diện phải sử dụng.

Cục Thuế lưu ý những bất cập nếu áp dụng cơ chế GTGT riêng cho nông nghiệp

Đối với kiến nghị về thuế GTGT đầu vào phục vụ hoạt động sản xuất, Cục Thuế cho biết do Hiệp hội chưa cung cấp hồ sơ, tài liệu cụ thể nên cơ quan này đưa ra ý kiến trên cơ sở các quy định chung của pháp luật hiện hành.

Theo Cục Thuế, thuế GTGT được xác định theo hàng hóa, dịch vụ, không phân biệt đối tượng và mục đích sử dụng. Luật Thuế GTGT không quy định về việc miễn, giảm thuế GTGT.

Tuy nhiên, chính sách thuế hiện hành đã dành nhiều ưu đãi cho lĩnh vực nông nghiệp thông qua quy định về đối tượng không chịu thuế và mức thuế suất ưu đãi.

Cụ thể, sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành các sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường của tổ chức, cá nhân tự sản xuất, đánh bắt bán ra và ở khâu nhập khẩu thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

Doanh nghiệp, hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã mua các sản phẩm này để bán cho doanh nghiệp, hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã khác không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT nhưng được khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

Một số nhóm hàng hóa phục vụ sản xuất nông nghiệp như giống vật nuôi, vật liệu nhân giống cây trồng, thức ăn chăn nuôi và thức ăn thủy sản cũng thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT theo quy định.

Đối với mức thuế suất GTGT 5%, pháp luật hiện hành áp dụng đối với một số sản phẩm, hàng hóa và dịch vụ phục vụ sản xuất nông nghiệp như phân bón, quặng để sản xuất phân bón, thuốc bảo vệ thực vật, chất kích thích tăng trưởng vật nuôi.

Một số dịch vụ phục vụ sản xuất nông nghiệp như đào đắp, nạo vét kênh, mương, ao, hồ; nuôi trồng, chăm sóc, phòng trừ sâu bệnh cho cây trồng; sơ chế, bảo quản sản phẩm nông nghiệp cũng thuộc diện áp dụng thuế suất 5%.

Theo Cục Thuế, trong trường hợp xây dựng một chính sách thuế GTGT đầu vào riêng cho hoạt động nông nghiệp có thể phát sinh hai vấn đề đáng lưu ý.

Thứ nhất, việc xác định và liệt kê đầy đủ các loại hàng hóa, dịch vụ được coi là đầu vào của lĩnh vực nông nghiệp là không đơn giản.

Thứ hai, chính sách riêng có thể dẫn đến sự bất bình đẳng giữa những người nộp thuế khi cùng sử dụng một loại hàng hóa, dịch vụ nhưng thuộc các lĩnh vực hoặc đối tượng khác nhau.

Từ những phân tích trên, Cục Thuế đề nghị Hiệp hội Rau quả Việt Nam thực hiện theo các quy định hiện hành về thuế GTGT và hóa đơn điện tử.

Việc phản hồi kiến nghị của Hiệp hội cho thấy những vướng mắc phát sinh từ thực tiễn sản xuất, thu mua nông sản đang tiếp tục được cộng đồng doanh nghiệp và tổ chức Hội phản ánh tới cơ quan quản lý, qua đó góp phần làm rõ chính sách và hoàn thiện môi trường pháp lý cho hoạt động sản xuất, kinh doanh nông nghiệp.